O Ministério foi criado em 5 de agosto de 2005 com a missão de atuar na construção de uma relação étnico/racial justa, com ênfase na população afrodescendente, não buscando separação, mas inclusão e diálogo com as diferentes instâncias da Igreja Metodista e sua membresia.​

O objetivo inicial do Ministério era disponibilizar e capacitar líderes para trabalhar com a temática da inclusão e diversidade com a formação de ministérios locais de Ações Afirmativas Afrodescendentes. 
Ações Afirmativas Afrodescendentes, são ações que objetivam o incentivo, o respeito e a inclusão da população Afro-brasileira de forma mais igualitária, haja vista os números discrepantes que assolam esta população.

John Wesley, fundador do metodismo, se colocava contra a escravidão e a Igreja Metodista é uma das pioneiras no desafio da inclusão no Brasil. Os documentos sociais enfatizam a necessidade de ações afirmativas, por exemplo:, “é injusto aumentar a riqueza dos ricos e o poder dos fortes confirmando a miséria dos pobres e oprimidos. Os programas para aumentar a renda nacional precisam criar distribuição equitativa de recursos, combater a discriminações, injustiças econômicas e libertar o ser humano da pobreza” (Credo Social da Igreja Metodista); 

“Há necessidade de apoiar todas as iniciativas que preservam e valorizam a vida humana […] a missão acontece quando a Igreja sai de si mesma, envolve-se na comunidade e se torna instrumento da novidade do Reino de Deus. À luz do conhecimento da Palavra de Deus, em confronto com a realidade, discernindo os sinais do tempo presente, a Igreja trabalha, assumindo os dramas e esperanças do nosso povo” (Plano para a Vida e Missão da Igreja).

A Igreja Metodista reconheceu com a criação deste importante Ministério Regional, que precisamos avançar na nossa proposta evangelística dentro dos desafios de uma comunidade que inclui, especialmente, por conta do elevado índice de negros e negras que vivem à margem da sociedade.

Por isso o Ministério AA-Afro se propõe a ser um espaço de valorização da cultura à luz dos valores do Reino de Deus e também um espaço educativo, a fim de que a Igreja, como sinal do amor de Deus, seja exemplo de inclusão, de Paz, de justiça social, de solidariedade e principalmente de combate ao racismo e discriminação em todas as suas formas à população Afrodescendente. 

Por fim, nas palavras do metodista Nélson Rolihlahla Mandela (1918-2013): “Ninguém nasce odiando outra pessoa pela cor da sua pele, por sua origem ou ainda por sua religião. Para odiar as pessoas precisam aprender, e se podem aprender a odiar podem ser ensinadas a amar”.